Iranian Journal of Endocrinology and Metabolism

fa شناسایی اثرات متقابل برخی پلی‌مورفیسم‌های ژنی موثر بر سطح پایین HDL در طول زمان با استفاده از رگرسیون منطقی انتقال: مطالعه‌ی قند و لیپید تهران Studying the Interaction Effects of Gene Polymorphisms on Low Level of HDL Over Time Using Transition Logic Regression: Tehran Lipid and Glucose Study ژنتيك Genetic پژوهشی Original مقدمه: با توجه به ارتباط بین لیپوپروتئین باچگالی بالا (HDL) و بیماری‌های قلبی ـ عروقی، شناسایی عوامل موثر بر سطح کلسترول ـ HDL می‌تواند در کاهش ابتلا به این بیماری‌ها موثر باشد. علاوه بر عوامل بیوشیمی و محیطی، تقابل‌‌های ژنتیکی نیز بر میزان کلسترول ـ HDL تاثیرگذارند. با توجه به وابسته بودن تاثیر پلی‌مورفیسم‌ها به زمان، بررسی اثر تقابل‌های ژنی روی کلسترول ـ HDL در طول زمان نیز دارای ‌اهمیت است. در این مقاله با بسط رگرسیون منطقی به داده‌های طولی دوحالتی، مدل "رگرسیون منطقی انتقال" معرفی، و به‌ وسیله‌ی آن اثرات متقابل پلی‌مورفیسم‌های موثر بر کلسترول ـ HDL در طول زمان بررسی گردید. مواد و روش‌ها: داده‌های طولی 329 نفراز شرکت‌‌کنندگان سه فاز مطالعه‌ی قند و لیپید تهران به منظور بررسی ارتباط بین پلی‌مورفیسم‌ها و سایر عوامل خطرساز با سطح پایین کلسترول ـ HDL درطول زمان با استفاده از مدل پیشنهادی تحلیل شدند. یافته‌ها: ترکیب ‌منطقی داشتن اندازه‌ی دور ‌کمر بالا و تری‌گلیسرید بالا با نسبت شانس 29/2 و فاصله‌ی‌ اطمینان 95% (48/3 و 51/1) تاثیر معنی‌داری بر سطح HDL داشت. هم‌چنین افرادی که در فاز دوم مطالعه دارای ژنوتایپ +/+ برای ژن ApoA1M1 یاCC برای ژن ApoCIII بودند، شانس بیشتری برای داشتنHDL ‌پایین داشتند ]نسبت شانس: 30/2، فاصله ‌اطمینان 95%: (99/2 و 77/1)[. مردان با فشار خون ‌بالا یا افرادی با ژنوتیپ AA برای ژنSRB1 شانس کمتری برای داشتنHDL پایین داشتند ]نسبت شانس: 38/0 فاصله‌اطمینان 95%: (59/0 و 25/0)[. نتیجه‌گیری: با توجه به لزوم شناسایی تقابل‌های ژنی در مطالعات ژنتیکی و نیز اهمیت بررسی این تقابل‌ها در طول زمان، مدل رگرسیون منطقی انتقال معرفی و برای بررسی تقابل‌های ژنی موثر بر سطح HDL در طول زمان استفاده شد. Introduction: As High-density lipoprotein (HDL) is directly associated with cardiovascular disease, the factors affecting the levels of this fat can be effective in reducing heart diseases. In addition to biochemical and environmental factors, genetic interactions also affect HDL level. Since polymorphism effects can be time-dependent, study of genetic interactions on HDL over time is important. In this study, we proposed Transition Logic Regression to analyze interactions in binary longitudinal data and used it to investigate polymorphism interactions related to low HDL over time. Materials and Methods: Data of 329 subjects who participated in three phases of TLGS was analyzed using the proposed model. Results: Results showed that subjects with high triglyceride levels and increased waist circumference have an odds ratio of 2.29 (CI95%: 1.51, 3.48) of having low HDL. Also, being in phase 2 and being a carrier of the minor allele of ApoA1M1 or being homozygous for the common allele of ApoCIII, were associated with an increased odds of having low HDL (OR= 2.30, CI95%: 1.77, 2.99). The odds ratio for having low HDL in male subjects with high blood pressure or being homozygous for the minor allele of SRB1 is 0.38 (CI95%: 0.25,0.59). Conclusions: Considering the identification of gene interactions in genetic studies and their importance over time, Transition Logic Regression was introduced and used to find gene interactions influencing low HDL over time and the most important models for gene interactions were identified. رگرسیون منطقی، اثرمتقابل، داده‌های طولی، مدل انتقالی، پلی‌مورفیسم، HDL Logic Regression, Interaction effect, longitudinal data, Transition model, SNP, HDL 352 359 http://ijem.sbmu.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1341-2&slc_lang=fa&sid=1 Parvin Sarbakhsh پروین سربخش p.sarbakhsh@gmail.com 4000319475328460021160 4000319475328460021160 No Department of Biostatistics, School of Paramedicine Shahid Beheshti University of Medical Sciences گروه آمار زیستی دانشکده پیراپزشکی، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی Yadollah Mehrabi یدالله محرابی mehrabi@sbmu.ac.ir 4000319475328460021161 4000319475328460021161 Yes Department of Epidemiology,School of Public Health, Shahid Beheshti University of Medical Sciences دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی Maryam Daneshpour مریم السادات دانشپور daneshpour1388@gmail.com 4000319475328460021162 4000319475328460021162 No Cellular and Molecular Endocrine Research Center, Research Institute for Endocrine Sciences, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran. مرکز تحقیقات سلولی و مولکولی غدد درون ریز، پژوهشکده علوم غدد درون ریز، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران Farid Zayeri فرید زایری fzayeri@yahoo.com 4000319475328460021163 4000319475328460021163 No Proteomics Research Center, Shahid Beheshti University of Medical Sciences مرکز تحقیقات پروتئومیکس، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی Maryam Zarkesh مریم زرکش maryamzarkesh@yahoo.com 4000319475328460021164 4000319475328460021164 No Cellular and Molecular Endocrine Research Center, Research Institute for Endocrine Sciences, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran. مرکز تحقیقات سلولی و مولکولی غدد درون ریز، پژوهشکده علوم غدد درون ریز، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران Feridoun Azizi فریدون عزیزی azizi@endocrine.ac.ir 4000319475328460021165 4000319475328460021165 No Research Institute for Endocrine Sciences Shahid beheshti University of Medical Sciences. مرکز تحقیقات غدد درون ریز پژوهشکده علوم غدد درون ریز و متابولیسم